단일세포 공간 전사체학 데이터에서 세포 간 통신 네트워크 추론을 위한 그래프 이론 적용

단일세포 공간 전사체학 데이터는 세포의 위치 정보를 포함하여 유전자 발현 패턴을 제공하며, 이를 통해 세포 간의 상호작용 네트워크를 구축할 수 있습니다. 이 네트워크 추론에는 생물정보학적 접근 방식이 필수적입니다.

네트워크 추론 방법론

• 세포 유형 분류 및 클러스터링을 통해 잠재적 상호작용 파트너를 식별합니다.
• 특정 유전자 발현 패턴(예: 사이토카인 분비)을 기반으로 세포 간의 신호전달 관계를 그래프 형태로 모델링합니다.
• 그래프 이론적 알고리즘(예: 커뮤니티 탐지)을 사용하여 밀접하게 상호작용하는 세포 그룹을 식별하고, 이는 세포 간 통신의 핵심 모듈을 나타냅니다.

이러한 분석은 면역학 반응이나 종양 미세환경 내의 복잡한 상호작용을 이해하는 데 중요한 기초 자료를 제공합니다. 관련 분야로는 공간 전사체학 및 시스템 생물학이 있습니다.